Die Welt des Jahres 2707 bietet kaum noch Ressourcen. Außerdem wurde sie von vier alles beherrschenden Konzernen in einen permanenten Kriegszustand gestürzt. Besonders heftig tobt die Schlacht zwischen Bauhaus und Capitol im einstigen Europa. Was die Soldaten um Maj. "Mitch" Hunter (Thomas Jane) und seinen Freund Capt. Nathan Rooker (Sean Pertwee) auf der Seite von Capitol sowie Lt. Maximillian von Steiner (Benno Fürmann) auf Seiten von Bauhaus nicht ahnen: Sie tragen ihr Gefecht genau über einer tief vergrabenen Maschine aus. Die stürzte einst aus dem All auf die Erde und wird nun durch ein heftiges Bombardement freigelegt. Im Nu strömen Mutanten aus der Maschine, die sich rasch vermehren. Die Führer der Menschheit, allen voran der weise Constantine (John Malkovich), sehen nur eine Chance: die Flucht mithilfe von Raumschiffen. Allerdings kann nur einen Bruchteil der Bevölkerung gerettet werden. Da bittet der Geistliche Bruder Samuel (Ron Perlman) Constantine um einen Gefallen. Sein Orden, der über die Maschine wachen sollte, besitzt jene Chroniken, die ankündigen, dass ein Auserwählter die Maschine zerstören und die Menschheit retten wird. Samuel, der sich selbst für diesen Auserwählten hält, bekommt von Constantine die Erlaubnis, mit einem Team von Soldaten in das Herz der Maschine einzudringen.